一、个人信息
姓名：刘笑
职称：高级实验师
专业：原子与分子物理
学历层次：博士研究生
办公室地点：实训楼2209室
电子邮箱：xiaoliu@sues.edu.cn
研究方向：计算机辅助药物设计
1.靶标先导化合物发现与候选药物设计
2.药物分子-靶蛋白结合自由能计算方法开发与相互作用机制研究
3.蛋白-蛋白相互作用机制研究
4.主-客体结合自由能精确方法发展
二、教育经历
2013.07-2018.06 华东师范大学精密光谱科学与技术国家重点实验室原子与分子物理专业获博士学位
2009.09-2013.07 河南师范大学物理学师范专业获学士学位
三、工作经历
2023.12-至今必威西汉姆联官网高级实验师
2019.03-2023.12 必威西汉姆联官网讲师
2018.09-至今上海纽约大学博士后、访问学者
四、代表性论著（2018年至今）
1.Xiao Liu1, Long Peng1, Yifan Zhou, Youzi Zhang and John Z.H. Zhang*,“Computational Alanine Scanning with Interaction Entropy for Protein-ligand Binding Free Energies.” (J. Chem. Theory Comput. 2018, 14, 3, 1772-1780.)
2. Xiao Liu1, Long Peng1 and John Z.H. Zhang*,“Accurate and Efficient Calculation of Protein-Protein Binding Free Energy-Interaction Entropy with Residue Type Specific Dielectric Constants.” (J. Chem. Inf. Model. 2019, 59, 1, 272-281.)
3. Shuaizhen Tian, Jinze Zeng, Xiao Liu*, Jianzhong Chen, Tong Zhu*, John Z.H.Zhang, “Understanding the selectivity of inhibitors toward PI4KIIIα and PI4KIIIβ based molecular modeling.” (Phys. Chem. Chem. Phys.,2019, 21, 2210322112.)
4. Xiao Liu, Yang Zhao*, John Z.H.Zhang*, “Molecular mechanism of ligand bindings to Zika virus at SAM site.”(Chemical Physics Letters 735 (2019) 136771)
5.Liu, X.*, Zheng, L., Qin, C. et al. Comprehensive evaluation of end-point free energy techniques in carboxylated-pillar[6]arene host–guest binding: I. Standard procedure. J Comput Aided Mol Des 36, 735–752 (2022).
6.Liu, X.*, Zheng, L., Cong, Y. et al. Comprehensive evaluation of end-point free energy techniques in carboxylated-pillar[6]arene host–guest binding: II. regression and dielectric constant. J Comput Aided Mol Des 36, 879–894 (2022).
7.Liu, X.*; Zheng, L.; Qin, C.; Cong, Y.; Zhang, J.Z.H.; Sun, Z. Comprehensive Evaluation of End-Point Free Energy Techniques in Carboxylated-Pillar[6]arene Host–Guest Binding: III. Force-Field Comparison, Three-Trajectory Realization and Further Dielectric Augmentation. Molecules 2023, 28, 2767.
8. Xiao Liu*, Lei Zheng, Chu Qin, Yang Li, John Z. H. Zhang, and Zhaoxi Sun. Screening Power of End-Point Free-Energy Calculations in Cucurbituril Host–Guest Systems .Journal of Chemical Information and Modeling 2023 63 (21), 6938-6946.
9.Xiao Liu*, Kaiwen Pang, Hangfei Wu, Xiaohui Wang, John Z. H. Zhang, and Zhaoxi Sun.
All-Atom Perspective of the DENV-3 Methyltransferase Inhibition Mechanism.The Journal of Physical Chemistry B 2024 128 (50), 12358-12367.
五、代表性科研项目
1.国家自然科学基金青年基金，2022.01-2024.12 主持，已结题。
2.上海市教委高校青年教师培育计划，2021.12-2023.12 主持，已结题。
3.上海市教委教师教学发展产学研项目，2022.12-2024.12 主持，已结题。
4.国家重点研发计划，2016YFA0501700， 参与，已结题。
5.国家自然科学基金（面上）项目，21673074，参与，已结题。
6.国际（地区）合作与交流项目，21761132022，参与，已结题。
六、主要荣誉奖励
2018.06 第二届世界华人生物计算和分子模拟大会优秀墙报奖
2019.05 必威西汉姆联官网青年五四奖章（个人）
2020.12 必威西汉姆联官网产学合作优秀协调员
2021.12 必威西汉姆联官网产学合作先进工作者
2023.12必威西汉姆联官网个人年度考核优秀
七、主要学术组织社会兼职
PPAR research、Journalof Biomolecular Structure & Dynamics等期刊审稿人
